Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms