Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms