Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms