Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VLDLRP98155 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms