Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMF1P82094 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMF1P82094 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMF1P82094 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMF1P82094 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMF1P82094 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMF1P82094 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms