Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms