Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCE1P61221 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms