Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
FAM3BP58499 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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FAM3BP58499 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3BP58499 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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FAM3BP58499 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
FAM3BP58499 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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