Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A2P55011 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms