Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAD23BP54727 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAD23BP54727 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms