Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNA3P52797 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNA3P52797 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms