Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTPAP49638 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTPAP49638 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTPAP49638 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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