Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RANGAP1P46060 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms