Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LTBRP36941 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms