Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCGF2P35227 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCGF2P35227 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCGF2P35227 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms