Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL9P32969 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL9P32969 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms