Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA7P31268 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms