Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTNNA2P26232 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNA2P26232 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms