Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NFKBIAP25963 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NFKBIAP25963 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms