Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms