Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPREP23469 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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