Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CAPN3P20807 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms