Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EGR1P18146 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EGR1P18146 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
EGR1P18146 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms