Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMD1P17707 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMD1P17707 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMD1P17707 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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