Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACADSP16219 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACADSP16219 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms