Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BMP3P12645 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms