Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VPREB1P12018 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms