Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C8orf88P0DMB2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms