Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RGPD2P0DJD1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms