Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHOP08100 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHOP08100 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHOP08100 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHOP08100 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHOP08100 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms