Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
IGKV4-1P06312 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms