Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR1AO95602 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms