Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
UBXN7O94888 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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UBXN7O94888 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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UBXN7O94888 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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UBXN7O94888 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UBXN7O94888 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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