Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CACNA1GO43497 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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