Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TO15178 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TO15178 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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