Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNMO15061 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNMO15061 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNMO15061 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms