Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RAB19A4D1S5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB19A4D1S5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms