Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM89A2RUT3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms