Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TNPO3Q9Y5L0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TNPO3Q9Y5L0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms