Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL27Q9Y4X3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms