Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AFG3L2Q9Y4W6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms