Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
POMPQ9Y244 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
POMPQ9Y244 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms