Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms