Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms