Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF8Q9UPP1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms