Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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COPS3Q9UNS2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
COPS3Q9UNS2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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COPS3Q9UNS2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COPS3Q9UNS2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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