Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MID2Q9UJV3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MID2Q9UJV3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms