Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPC1L1Q9UHC9 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms