Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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