Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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